Luc Abbadie est professeur émérite à Sorbonne Université où il a enseigné l'écologie générale, l’écologie fonctionnelle et la biogéochimie. 

Il a créé et géré plusieurs formations de niveau licence et master à caractère pluridisciplinaire. Il a été rapporteur du rapport Jouzel "Enseigner la transition écologique dans le supérieur" (Janvier 2022). Il est actuellement membre du bureau du GREC francilien et vice-président du conseil scientifique de l’Office français de la biodiversité.

Il a conduit des travaux de recherche sur les cycles du carbone et de l’azote et sur le fonctionnement des sols et des écosystèmes, dans la zone tropicale comme dans la zone tempérée. Il a lancé de nombreux travaux interdisciplinaires dans le domaine de l'environnement et des applications de l’écologie pour la gestion durable de la biodiversité, des ressources naturelles et des écosystèmes (ingénierie écologique) et a piloté un ensemble de recherches en écologie urbaine.